近年の科学技術の進歩に伴い、食品製造施設の衛生管理技術も大幅に改善されてきています。　また、社会の「食の安全」への関心の高まりとともに、食品取り扱い者の衛生意識、衛生管理技術も向上してきています。
　しかし、食中毒事件は依然として減少する傾向はなく、「食の安全・安心」を脅かし続けています。これらの事件の発生原因のほとんどは微生物（特に細菌）によるもので、正しい衛生管理により付着・増殖を防ぎ、殺菌することが出来ます。
　食品が細菌による汚染から守られているか、食中毒予防の３原則「付けない・増やさない・殺菌」が、すべての製造工程、食品取扱い工程で確実に守られているか、検証するためには微生物検査が必要となります。
　検証のための検査は、食品衛生法に規定される微生物検査「一般生菌数と大腸菌群」を基本とし、最近では、検証対象の食品に関連ある食中毒菌を品質管理・衛生管理の指標に含めて検査するようになってきました。
　食品提供前の自主検査を行なうことで、「食品中の潜在（一次汚染）」「取扱い中の汚染（二次汚染）」に起因する有害微生物を発見し、それにより引き起こされる健康障害を未然に防ぐことが出来ます。
　さらに、検査結果を「衛生管理の改善」「食品取扱い者の意識向上・教育の徹底など」へ役立てることが出来ます。

　食品の特性により、検査対象菌や検査方法が異なります。食品の規格基準が設定されている場合は、その規格基準に適しているかどうかを検証することが、1つの検査目的になります。もう1つの目的として「品質管理」があります。食品が衛生的に取り扱われ「一次汚染、二次汚染」が確実に防止されているか評価し、改善し続けることが自主管理として重要です。

　食品に滅菌希釈液を加え、ストマッカー（食品と希釈液を均一にする機器）で、均質化した試料原液を作製します。
　その試料原液および10倍毎に希釈倍率を上げた試料を用いて、混釈平板培養法にて培養検査します。
　ふ卵器で規定された時間培養し、発育した集落を数え、実数を報告します。
※上記検査方法は一般生菌数・大腸菌群数に関するものです。
※他の検査項目も食品微生物検査マニュアルに準じて実施します。
検査結果は
　一般生菌数：「＜300」「実数」（集落数が300以上の場合、実数の報告）
　大腸菌群数：「＜10」「実数」（集落数が10以上の場合、実数の報告）
　黄色ブドウ球菌、腸炎ビブリオ、セレウス菌、サルモネラ菌：「陰性」「陽性」で報告します。

検査項目	検査日数	必要量 (1回／1検査)	検査食材	使用容器
①一般生菌数・大腸菌群数	2～6日	100g	基本項目	こちら
②一般生菌数・大腸菌(E.coli)・黄色ブドウ球菌	2～5日	100g	麺類(茹で・生)、惣菜類(加熱済み)
③一般生菌数・大腸菌群数・黄色ブドウ球菌・腸炎ビブリオ(定性)	2～6日	100g	魚介類(生魚介類)
④一般生菌数・大腸菌(E.coli)・黄色ブドウ球菌・セレウス菌	2～5日	100g	野菜類、穀物類
⑤一般生菌数・大腸菌群数・黄色ブドウ球菌・サルモネラ菌	4～6日	100g	卵、卵加工品及び乳、乳製品類
⑥一般生菌数・大腸菌群数・黄色ブドウ球菌・サルモネラ菌・カンピロバクター	4～6日	100g	生肉及び加工肉
⑦一般生菌数・大腸菌群数・真菌(カビ・酵母)	2～14日	100g	漬物
⑧一般生菌数・大腸菌群数・黄色ブドウ球菌・真菌(カビ・酵母)	2～14日	100g	生菓子、乾製品、穀物加工品